La rivière Saint-Denis est un sous-bassin versant de la rivière Kamouraska. Théoriquement, elle est la rivière principale de ce bassin versant puisque c’est la rivière Kamouraska qui se jette dans la rivière Saint-Denis. Ce sont elle et ses affluents que l’on retrouve le plus en amont. Cette station est considérée de référence puisque l’utilisation du territoire en amont est dominée par la forêt; quoiqu’à plus de 5 km de la station, la rivière traverse la municipalité de Saint-Bruno-de-Kamouraska. Cette station est suivie depuis 2008 en collaboration avec le cégep de La Pocatière. Les affluents sont reconnus pour la présence d’omble de fontaine.

Les changements climatiques pourraient avoir des impacts sur la qualité de l’habitat et ainsi sur la communauté de macroinvertébrés, source de nourriture de l’omble de fontaine.

Les données passées permettre de qualifier l'eau comme excellente ainsi que la qualité de l'habitat.